MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 55991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015574	A	6	6	144669	144674	100 %	0 %	0 %	0 %	333986360
3002	NC_015574	ACA	2	6	144693	144698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986360
3003	NC_015574	TGG	2	6	144756	144761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986360
3004	NC_015574	T	6	6	144843	144848	0 %	100 %	0 %	0 %	333986360
3005	NC_015574	ATC	2	6	144902	144907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015574	TAT	2	6	144946	144951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015574	ATT	2	6	144976	144981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015574	A	8	8	144997	145004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015574	TGAA	2	8	145019	145026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015574	AAT	2	6	145040	145045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015574	TGG	2	6	145072	145077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015574	TAA	2	6	145143	145148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015574	TAAA	2	8	145169	145176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015574	T	6	6	145234	145239	0 %	100 %	0 %	0 %	333986361
3015	NC_015574	ATG	2	6	145361	145366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986361
3016	NC_015574	GAT	2	6	145382	145387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986361
3017	NC_015574	T	6	6	145525	145530	0 %	100 %	0 %	0 %	333986361
3018	NC_015574	GTT	2	6	145652	145657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986361
3019	NC_015574	CTAC	2	8	145673	145680	25 %	25 %	0 %	50 %	333986361
3020	NC_015574	TCT	2	6	145754	145759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986361
3021	NC_015574	AATT	2	8	145788	145795	50 %	50 %	0 %	0 %	333986361
3022	NC_015574	GTT	2	6	145844	145849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986361
3023	NC_015574	ATG	2	6	145850	145855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986361
3024	NC_015574	T	6	6	145867	145872	0 %	100 %	0 %	0 %	333986361
3025	NC_015574	CTG	2	6	145896	145901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986361
3026	NC_015574	TGA	2	6	145919	145924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986361
3027	NC_015574	TCT	2	6	145973	145978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986361
3028	NC_015574	ACA	2	6	146168	146173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986361
3029	NC_015574	GTC	2	6	146212	146217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986361
3030	NC_015574	ATCC	2	8	146232	146239	25 %	25 %	0 %	50 %	333986361
3031	NC_015574	TGG	2	6	146257	146262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986361
3032	NC_015574	T	6	6	146332	146337	0 %	100 %	0 %	0 %	333986361
3033	NC_015574	GTTTT	2	10	146340	146349	0 %	80 %	20 %	0 %	333986361
3034	NC_015574	CTT	2	6	146373	146378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986361
3035	NC_015574	ACT	2	6	146414	146419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015574	ATTTTT	2	12	146420	146431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015574	TAT	2	6	146445	146450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015574	T	7	7	146465	146471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015574	AATT	2	8	146487	146494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015574	T	8	8	146507	146514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015574	T	7	7	146530	146536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015574	TAT	2	6	146539	146544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015574	TGTTT	2	10	146666	146675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015574	TTAT	2	8	146677	146684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015574	AAG	2	6	146714	146719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015574	CTT	2	6	146723	146728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015574	TAC	2	6	146776	146781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015574	ACA	2	6	146782	146787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015574	AT	4	8	146788	146795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015574	T	6	6	146803	146808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015574	TA	3	6	146824	146829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015574	AC	3	6	146855	146860	50 %	0 %	0 %	50 %	333986362
3053	NC_015574	AGC	2	6	146907	146912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986362
3054	NC_015574	AAGGG	2	10	146925	146934	40 %	0 %	60 %	0 %	333986362
3055	NC_015574	AGAA	2	8	146942	146949	75 %	0 %	25 %	0 %	333986362
3056	NC_015574	ATA	2	6	147109	147114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986362
3057	NC_015574	AG	3	6	147131	147136	50 %	0 %	50 %	0 %	333986362
3058	NC_015574	TGA	2	6	147197	147202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986362
3059	NC_015574	CTA	2	6	147284	147289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986362
3060	NC_015574	A	6	6	147312	147317	100 %	0 %	0 %	0 %	333986362
3061	NC_015574	CAG	2	6	147369	147374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986363
3062	NC_015574	CTTT	2	8	147389	147396	0 %	75 %	0 %	25 %	333986363
3063	NC_015574	GTTG	2	8	147413	147420	0 %	50 %	50 %	0 %	333986363
3064	NC_015574	TGA	2	6	147496	147501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986363
3065	NC_015574	AAAT	2	8	147507	147514	75 %	25 %	0 %	0 %	333986363
3066	NC_015574	TAT	2	6	147534	147539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986363
3067	NC_015574	AT	4	8	147615	147622	50 %	50 %	0 %	0 %	333986363
3068	NC_015574	ATC	2	6	147634	147639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986363
3069	NC_015574	GAT	2	6	147653	147658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986363
3070	NC_015574	AGAT	2	8	147730	147737	50 %	25 %	25 %	0 %	333986363
3071	NC_015574	GATA	2	8	147763	147770	50 %	25 %	25 %	0 %	333986363
3072	NC_015574	GAT	2	6	147854	147859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986363
3073	NC_015574	GACAAA	2	12	147887	147898	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333986363
3074	NC_015574	A	6	6	147920	147925	100 %	0 %	0 %	0 %	333986363
3075	NC_015574	AGA	2	6	147994	147999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986363
3076	NC_015574	TG	3	6	148040	148045	0 %	50 %	50 %	0 %	333986363
3077	NC_015574	GCA	2	6	148082	148087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986363
3078	NC_015574	AC	4	8	148318	148325	50 %	0 %	0 %	50 %	333986363
3079	NC_015574	TAAAAC	2	12	148366	148377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333986363
3080	NC_015574	TG	3	6	148437	148442	0 %	50 %	50 %	0 %	333986364
3081	NC_015574	CATC	2	8	148462	148469	25 %	25 %	0 %	50 %	333986364
3082	NC_015574	GGT	2	6	148485	148490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986364
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3084	NC_015574	ATG	2	6	148518	148523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986364
3085	NC_015574	TTA	2	6	148537	148542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986364
3086	NC_015574	CTGG	2	8	148610	148617	0 %	25 %	50 %	25 %	333986364
3087	NC_015574	A	7	7	148755	148761	100 %	0 %	0 %	0 %	333986365
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3090	NC_015574	ATTC	2	8	148937	148944	25 %	50 %	0 %	25 %	333986365
3091	NC_015574	CTG	2	6	148988	148993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986365
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3093	NC_015574	AAG	2	6	149044	149049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986365
3094	NC_015574	A	6	6	149085	149090	100 %	0 %	0 %	0 %	333986365
3095	NC_015574	CT	3	6	149121	149126	0 %	50 %	0 %	50 %	333986365
3096	NC_015574	GA	3	6	149134	149139	50 %	0 %	50 %	0 %	333986365
3097	NC_015574	A	9	9	149151	149159	100 %	0 %	0 %	0 %	333986365
3098	NC_015574	AGG	2	6	149162	149167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986365
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3102	NC_015574	TTA	2	6	149352	149357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986366
3103	NC_015574	CAA	2	6	149548	149553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986366
3104	NC_015574	GTGAA	2	10	149614	149623	40 %	20 %	40 %	0 %	333986366
3105	NC_015574	GTT	2	6	149640	149645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986366
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3107	NC_015574	GAA	2	6	149811	149816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986366
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3109	NC_015574	AGA	2	6	149903	149908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986366
3110	NC_015574	GGATTA	2	12	149964	149975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986366
3111	NC_015574	CTT	2	6	150057	150062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986366
3112	NC_015574	TCT	2	6	150100	150105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986366
3113	NC_015574	ACA	2	6	150177	150182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986366
3114	NC_015574	TGG	2	6	150257	150262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986366
3115	NC_015574	A	6	6	150417	150422	100 %	0 %	0 %	0 %	333986366
3116	NC_015574	A	6	6	150538	150543	100 %	0 %	0 %	0 %	333986367
3117	NC_015574	GTATA	2	10	150546	150555	40 %	40 %	20 %	0 %	333986367
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3121	NC_015574	ACAA	2	8	150656	150663	75 %	0 %	0 %	25 %	333986367
3122	NC_015574	AGA	2	6	150742	150747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986367
3123	NC_015574	AGA	2	6	150752	150757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986367
3124	NC_015574	CCA	2	6	150878	150883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986367
3125	NC_015574	AC	3	6	150895	150900	50 %	0 %	0 %	50 %	333986367
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3127	NC_015574	CAC	2	6	150939	150944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986367
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3366	NC_015574	TAAA	2	8	161845	161852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3371	NC_015574	CT	3	6	162210	162215	0 %	50 %	0 %	50 %	333986379
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